Kalau mendengar namanya saja pasti banyak orang sudah dapat menerka-nerka apa saja yang terdapat di dalam goa tersebut. Betul sekali!!! Asal muasal pemberian nama goa ini berasal dari kata  Lowo  (bahasa jawa) yang berarti  kelelawar. Banyak hewan malam yaitu kelelawar yang hidup di goa ini. Jumlahnya ratusan buah. Mereka bergelantungan di setiap lubang-lubang yang ada di sudut-sudut goa ini. Matanya sangat terlihat tajam dan menakutkan, tapi ini lah keunikan dari goa ini.

Berdasarkan survey yang dilakukan, di goa ini  terdapat beberapa jenis kelelawar yang hidup. Mulai dari kelelawar yang besar sampai bentuk kelelawar yang kecil. Warna dari kelelawar sendiri berwarna coklat sampai hitam pekat. Sehigga untuk memperoleh gambar kelelawar tersebut bukanlah hal yang mudah, di dukung dengan suasana goa yang gelap.