VISI
Generasi yang berkualitas dalam memakmurkan bumi dengan tingkat keimanan dan ketaqwaan yang tinggi, dan memiliki komitmen pada kesempurnaan (keunggulan), risalah islamiyah di bidang pendidikan, ilmu pengetahuan dan teknologi, serta mampu mengimplementasikan untuk kepentingan bersama.

MISI
1. Terwujudnya SMU Muhammadiyah 2 Yogyakarta sebagai Rahmatan Lil’alamin
2. Menegakkan wahyu Ilahi dan sunnah nabi sebagai sumber kebenaran mutlak serta rahmat bagi alam semesta, dan mendukung cita – cita luhur dan suci bangsa Indonesia dalam mencerdaskan kehidupan bangsa
3. Membentuk manusia muslim yang bertaqwa, berakhlaq, terampil, berilmu amaliah dan beramal ilmiah dengan pengabdian tinggi yang ditompang oleh ilmu pengetahuan dan teknologi

FASILITAS
- Ruang kelas yang representatif
- Mushola
- Laboratorium IPA (Biologi, Fisika, Kimia)
- Laboratorium IPS
- Laboratorium Matematika
- Laboratorium Al-Islam
- Laboratorium Bahasa
- Laboratorium Komputer Tingkat Dasar dan Tingkat Lanjut
- Ruang Audio Visual
- Sarana Olah Raga (Basket, Volley, Bulu tangkis, Panjat dinding, dll)
- Ruang Kesehatan / Poliklinik Umum dan Gigi
- Perpustakaan
- Gedung Serba Guna
- Asrama Putri
- Kantin dan Toko

EKSTRAKURIKULER
- Seni musik
- Seni baca Al-Quran
- Seni rupa
- Basket
- Voli
- Kelompok Ilmiah Remaja (KIR)
- Conversation (BEC)
- Hisbul Wathan
- Komputer
- Pencak Silat Tapak Suci
- Palang Merah Remaja
- Pecinta Alam (BHC)
- Peleton Inti (Pabhama)
- Teater (Basthema)
- Fotografi