Universitas Cokroaminoto Yogyakarta merupakan perguruan tinggi yang telah berpengalaman dalam memberikan pelayanan dan penyelenggaraan pendidikan tinggi bagi mahasiswa. UCY berpegang pada trilogi pendidikan sebagai acuan penyelenggaraan pendidikan tinggi, yaitu pembangunan mentalitas manusia yang bersumberkan pada Tauhid dan ajaran agama; penguasaan ilmu pengetahuan dan teknologi; serta kemampuan bertindak amaliah dan pribadi yang jujur.

Program Ganda (Double Degree) merupakan jenjang pendidikan S1 yang memadukan dua fakultas atau dua program studi yang relevan dan terpadu. Mahasiswa yang menempuh program ini dapat mengikuti perkuliahan di dua fakultas secara bersamaan, sehingga pada akhir masa studi, akan diperoleh dua gelar kesarjanaan dalam kurun waktu kurang lebih 5 tahun dengan biaya yang lebih murah dibandingkan dengan program biasa.

Program Ganda yang dikembangkan adalah Fakultas Ekonomi program studi Manajemen dengan Fakultas Agama Islam program studi Al-Ahwal Al-Syakhsiyyah (bergelar Sarjana Ekonomi dan Sarjana Hukum Islam). Kemudian paduan Fakultas Hukum program studi Ilmu Hukum dengan Fakultas Agama Islam program studi Al-Ahwal Al-Syakhsiyyah (bergelar Sarjana Hukum dan Sarjana Hukum Islam).

PROGRAM STUDI
FAKULTAS AGAMA ISLAM
Pendidikan Agama Islam (Psikoterapi Islam, Manajemen Pendidikan Islam, Pendidikan Anak Usia Dini), dan Al-Ahwal Al-Syakhsiyyah (Perdata Islam)

FAKULTAS EKONOMI
Manajemen (Manajemen Pemasaran, Manajemen Keuangan, Manajemen Produksi Operasional, Manajemen Sumber Daya Manusia, dan Manajemen Syari'ah Islam), dan Akuntansi (Akuntansi Keuangan)

FAKULTAS HUKUM
Ilmu Hukum (Hukum Perdata BW, Hukum Bisnis, Hukum Pidana, Hukum Administrasi Negara, dan Hukum Syari'ah Islam)

FAKULTAS TEKNIK
Teknik Sipil (Teknik Sipil Struktur, dan Manajemen Konstruksi)

FAKULTAS KEGURUAN DAN ILMU PENDIDIKAN
PPKn (Kewarganegaraan, dan Moral)

FASILITAS
- Perpustakaan
- Laboratorium Hukum
- Laboratorium Bahasa
- Laboratorium Komputer